دانشگاه علوم پزشکی تهران با بیش از 60 برنامه ثبت بیماری ها که بیش از 10 مورد از آنها به صورت ملی در حال اجرا است پیشتاز در برنامه های زیرساختی معاونت تحقیقات و فناوری در کشور می باشد. فهرست برنامه های ثبت در حال اجاری دانشگاه علوم پزشکی تهران به شرح زیر است: